Análisis
Existen distintas patologías asociadas genéticamente al color del manto: al consultar la bibliografía se citan distintos síndromes y anormalidades, pero no tendrá mayor provecho para nosotros si no conocemos realmente los fenotipos. Éste comentario puede hacerse extensivo a las razas.
En este trabajo trataremos los genes que controlan el color de los pelajes. Se le dará mayor importancia a los fenotipos y a través de ellos comprenderemos los genotipos, comenzando por los más simples y después se agregarán los distintos matices. Además, así profundizaremos los conocimientos sobre razas, ya que hay colores exclusivos para algunas de ellas, y al conocer los diferentes colores realizaremos las reseñas con mayor propiedad.
Imaginemos dos situaciones: en la primera, observamos un gato a la distancia y en su conjunto ¿Cuántos colores conforman su capa?. Habrá dos respuestas posibles: un solo color, desde el extremo del hocico hasta la punta de la cola, o más de un color, sin importar su disposición que puede ser en manchas, rayas o motas.
En el segundo caso, nos acercamos a ese gato y observamos cada uno de sus pelos, en forma aislada ¿Cómo se dispone el color a lo largo de la fibra?. Hay varias respuestas posibles: un mismo color ocupa toda la longitud del pelo, desde la raíz hasta la punta (color sólido), o puede ser que la coloración ocupa parcialmente cada uno de sus pelos en su extremo libre (colores punteados), o se advierte la disposición del pigmento en bandas a lo largo de la fibra, pudiendo intercalarse mas de un color de ésta forma (patrones tabby).

COLORES UNIFORMES / GATOS UNICOLORES
El gato es de un solo color, con igual intensidad en todo el cuerpo y en toda la longitud de la fibra.
Los alelos son:

Negro (black, foca, seal): es el ejemplo mas común. En algunos casos puede confundirse con un castaño muy oscuro.
Chocolate (pardo): corresponde a un color castaño. Canela (pardo claro, cinnamon): es un castaño todavía mas claro que el chocolate.
Rojo (red): es el comúnmente llamado naranja o pelirrojo. Está ligado al sexo por ubicarse su locus en la porción no homóloga del cromosoma x. Para manifestarse fenotípicamente de esta forma esta serie alélica debe ser acompañada por el gen D, en un claro ejemplo de epistasis. D es de tipo salvaje y controla la pigmentación densa, con gran intensidad. Su mutante d diluye la pigmentación porque tiene un efecto de "agregación" de los gránulos de pigmento que cambia el reflejo de la luz, resultando así un color mas claro que se denomina diluido o maltesado.
Azul (blue): color gris intenso, es ideal que posea un reflejo de tipo acerado.
Lila (lavanda, frost, escarcha): gris más claro que el azul, con tinte más "rosado".
Ciervo (lavanda claro, fawn): color beige claro.
Crema (cream): rubio pálido del tipo "té con leche".

Genotipos:

*Se presenta así porque en el caso de los machos habrá un solo gen.

BLANCO DOMINANTE UNICOLOR
Es un caso aparte y está regido por el gen W mutante. Cuando se introduce en un genotipo enmascara al resto de los genes, por eso al entrecruzar dos individuos blancos podemos obtener descendencia tanto blancos como de otro color, según la carga genética de los progenitores.
Todos los gatos que no son blancos poseen el alelo salvaje w en homocigosis, que controla la expresión máxima de todos los demás genes de color.
Los gatos blancos pueden tener el iris celeste, anaranjado o desiguales, y pueden padecer sordera.
Ejemplo: se produce un cruzamiento entre gato blanco genéticamente negro y una gata chocolate.
La F1 es blanca fenotípicamente y genéticamente negra.

TORTIE
Cuando nombramos al gen rojo y a su diluido el crema, dijimos que está ligado al sexo y que se presenta como O. Los machos tendrán un sólo O u o en su único cromosoma x, y las hembras pueden presentar en uno de sus x un O y en el otro un o no rojo que permite manifestar otro color en forma simultánea, ya sea negro o chocolate, o los diluidos azul o lila. A este pelaje se le denomina caparazón de tortuga, tortoishell, carey, o simplemente tortie.

Persa Tortoishell

Cuando decimos "tortie" ya se entiende que presentan rojo o crema (tortie blue, tortie chocolate, etc.). A las tortie azul o lila también se las llama "tortie diluidas" y se acompañan por el crema.

PATRÓN TABBY
Responde a la acción de dos genes en forma simultánea: el agoutí A, que produce el patrón de color de "fondo" y el T, que forma el dibujo en un esquema de rayas o manchas que se superpone al anterior. A es responsable de la disposición del color en bandas a lo largo del mismo pelo: el extremo libre es de color negro, su tercio central es amarillento y la base es de color grisáceo, dándole un aspecto "jaspeado" muy común en distintas especies, por ejemplo en los conejos. Entre los criadores se denomina "ticked" o simplemente "tiqueado".
En los colores sólidos el gen agoutí A salvaje ha sido reemplazado por su mutante recesivo aa no agoutí, lo que explica la distribución pareja del pigmento a lo largo de la fibra, salvo en el caso de los gatos rojos y cremas, donde su acción no es completa y así en éstos siempre habrá aunque sea un leve bandeado. En la cría selectiva se eligen los ejemplares con el menor bandeado posible.T es el gen salvaje rayado o mackerel (tabby) que determina la disposición en "rayas" formadas por pelos completamente negros que parten en forma irradiada desde la columna vertebral. A su vez T a sufrido mutaciones: los alelos son: Ta = tabby abisinio (la mutación es dominante sobre el salvaje T), donde no hay rayas en el cuerpo, pero sí algunas tenues en las extremidades, podría ser en la cola y manchas en la cara.tb = tabby manchado (classic): las rayas negras del cuerpo son circunvolutas. Un cuarto tipo de tabby, el moteado o spotted, presenta manchas uniformes en los laterales del cuerpo. En realidad no se conoce bien su genotipo pero se cree que hay un factor que produce la "ruptura" de las líneas del Mackerel o del Classic Tabby, limitando su expresión a motas. En todos los tabby hay, en mayor o menor grado: rayas en patas y cola, punta de la cola oscura, la típica "M" en la frente, una lista a lo largo de la columna vertebral, la línea a continuación de la comisura lateral del ojo y la piel del hocico de color anaranjado.

Genes spotted	Genes ticked

Genes mackerel	Genes blotched

TORBIE
Cuando en los patrones tortie se incluye el gen A, las manchas de color negro, chocolate, azul o lila tomarán el bandeado de colores. Las partes rojas o cremas sabemos que siempre lo conservan. A este color de pelaje se lo denomina tortie tabby, atigrado parchado, tortuga atigrado o simplemente "torbie", y así sus variedades torbie seal, torbie blue, etc.

MOTEADOS
Son los gatos, machos o hembras, que presentan blanco en su pelaje adicionado a cualquier otro color. Responde a la mutación S, que determina la aparición de manchas blancas en extensión variable. El gen salvaje s corresponde al color normal, sin blanco. Se cree que habría otro factor (un gen, grupo de genes, penetrancia/expresividad) que regula la extensión de las manchas blancas y les permite coexistir con otros patrones de color. Esto explica la presencia de manchas de un blanco puro alternadas con otros de los casos citados anteriormente:
blanco + color completo negro, gris, etc.
blanco + tabby en cualquiera de sus manifestaciones.
blanco + tortie = calicó (comúnmente llamadas "tricolores").

Según la proporción del blanco hay distintas denominaciones:
Particolor: motas blancas en proporción mínima.
Mitted: 1/4 del gato es blanco, en manos, piernas, abdomen, pecho y mentón.
Bicolor: 1/3 ó 2/3 del gato es blanco en extremidades, vientre, flancos y parte del rostro. Manchas de color en lomo, cola y cabeza.
Arlequin: el color está limitado a las extremidades, pueden aparecer algunas manchas en el cuerpo.
Esquema Van: es la máxima expresión del gen S, con color sólo en parte de la cabeza y cola y tal vez alguna mancha en el lomo.

COLORES PUNTEADOS
En los genotipos citados anteriormente se incluye el gen salvaje i, que permite el desarrollo del pigmento a lo largo de la fibra, y que es distinto del a no agoutí. Su mutación dominante I suprime esa pigmentación en una franja, que incluye la "base" del pelo. Esto quiere decir que, cuando observamos un gato unicolor, tabby o una tortie, que presenta I al "separar" su pelo, lo "abrimos", vamos a ver que las raíces son claras, y las puntas coloreadas dan una sensación de reflejo que logra una apariencia muy agradable. A esa porción del pelo coloreada se la llama "punteado". La franja de pelo sin colorear es de proporción variable, y así se clasifican como:
A) Chinchilla: franja pigmentada mínima.
B) Sombreado: la fracción del punteado es mayor.
C) Ahumado: sólo hay una banda clara y angosta cercana a la raíz, el resto es punteado.

En el grupo de los tabby, en el caso de los ahumados como el punteado es máximo el patrón se seguirá observando: veremos el patrón por el gen A agoutí y el superpuesto generado por T, y las raíces claras por el efecto causado por I. En el caso de los chinchilla, como el punteado es mínimo sólo se verán las puntas coloreadas, y por el efecto de I la acción del A no puede apreciarse. A estos "tabbies punteados" se los denomina plata o plateados, y su color puede ser negro, gris, chocolate o lila.

Cuando los gatos de genotipo unicolor incorporan I, allí sí se ve claramente la diferencia de pigmentación y la parte coloreada responde al negro, azul, chocolate o lila.

Cuando la parte punteada es de color rojo o crema, reciben el nombre de camafeo.

Las torties, tanto sólidas como diluidas, también pueden tener su "versión" punteada.

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